Как заставить BDE сохранять в БД поле времени с сотыми долями секунды

Если руками, то в BDE Administrator (BDE Configuration Utility).

Если при инсталляции твоей программы, то:

В пункте Make Registry Changes InstallShield'а создай ключ

HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Borland\Database Engine\Settings\SYSTEM\FORMATS\TIME\MILSECONDS=TRUE